> ## Documentation Index
> Fetch the complete documentation index at: https://docs.pho.chat/llms.txt
> Use this file to discover all available pages before exploring further.

# Scientific Skills

> 170+ kỹ năng khoa học — AI tự biết cách dùng 250+ databases và 60+ packages

# Scientific Skills 🧪

Phở Chat tích hợp **170+ kỹ năng khoa học** từ dự án [claude-scientific-skills](https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills), cung cấp truy cập vào **250+ cơ sở dữ liệu** và **60+ Python packages** được tối ưu.

## Cách bật

<Steps>
  <Step title="Vào Settings">
    Bấm icon ⚙️ ở góc dưới bên trái → chọn **Tools**.
  </Step>

  <Step title="Bật Phở Scientific Skills">
    Tìm tool **"Phở Scientific Skills"** → toggle **ON**.
  </Step>

  <Step title="Bắt đầu dùng">
    Quay lại chat → hỏi câu hỏi khoa học. AI sẽ tự động áp dụng kiến thức từ skills phù hợp.
  </Step>
</Steps>

## Danh mục kỹ năng

<AccordionGroup>
  <Accordion title="🧬 Bioinformatics & Genomics (20+ skills)">
    * **Sequence analysis**: BioPython, pysam, scikit-bio, BioServices
    * **Single-cell**: Scanpy, AnnData, scvi-tools, scVelo
    * **Genomic tools**: gget, deepTools, Zarr, TileDB-VCF
    * **Phylogenetics**: ETE Toolkit, MAFFT, IQ-TREE 2
  </Accordion>

  <Accordion title="🧪 Drug Discovery (13+ skills)">
    * **Molecules**: RDKit, Datamol, Molfeat
    * **Deep learning**: DeepChem, TorchDrug
    * **Docking**: DiffDock
    * **MD simulation**: OpenMM + MDAnalysis
    * **Cloud quantum chemistry**: Rowan
  </Accordion>

  <Accordion title="🏥 Clinical Research (16+ skills)">
    * **Databases**: ClinicalTrials.gov, ClinVar, ClinPGx, COSMIC
    * **Cancer**: cBioPortal, DepMap
    * **Disease-gene**: Monarch Initiative
    * **Healthcare AI**: PyHealth, NeuroKit2
  </Accordion>

  <Accordion title="🤖 Machine Learning & AI (16+ skills)">
    * **Deep learning**: PyTorch Lightning, Transformers
    * **Classical ML**: scikit-learn, SHAP
    * **Time series**: aeon, TimesFM
    * **Bayesian**: PyMC
    * **Graph ML**: Torch Geometric
  </Accordion>

  <Accordion title="📊 Data Analysis (17+ skills)">
    * **Visualization**: Matplotlib, Seaborn, Plotly
    * **Geospatial**: GeoPandas, GeoMaster
    * **Network**: NetworkX
    * **Symbolic math**: SymPy
    * **Infographics**: AI-powered infographic creation
  </Accordion>

  <Accordion title="🔬 Scientific Databases (37+ → 250+ total)">
    * **Protein**: UniProt, PDB, AlphaFold DB, InterPro
    * **Chemical**: PubChem, ChEMBL, DrugBank, ZINC, HMDB
    * **Genomic**: Ensembl, NCBI Gene, GEO, gnomAD, GTEx
    * **Clinical**: ClinVar, COSMIC, ClinicalTrials.gov
    * **Pathways**: KEGG, Reactome, STRING
  </Accordion>

  <Accordion title="📚 Scientific Communication (24+ skills)">
    * **Literature**: OpenAlex, PubMed, bioRxiv, Literature Review
    * **Writing**: Scientific Writing, Peer Review
    * **Presentations**: Scientific Slides, LaTeX Posters
    * **Diagrams**: Scientific Schematics, Mermaid
    * **Citations**: Citation Management
  </Accordion>

  <Accordion title="💹 Financial Research (5 skills)">
    * **SEC filings**: edgartools (10-K, 10-Q, 13F)
    * **US fiscal data**: usfiscaldata
    * **Macroeconomic**: FRED (800,000+ time series)
    * **Market data**: Alpha Vantage
  </Accordion>
</AccordionGroup>

## Knowledge Base (RAG)

Ngoài system prompt, 169 skill files còn được index thành **1695 document chunks** qua **10 domains** để AI có thể tra cứu chuyên sâu khi cần.

<Info>
  Bạn không cần biết Python hay bất kỳ ngôn ngữ lập trình nào. Chỉ cần mô tả nhu cầu bằng ngôn ngữ tự nhiên, AI sẽ tự chọn skill phù hợp.
</Info>